生物医学工程学院在2024年截止10月底，获得国家自然科学基金、安徽省自然科学基金、安徽省高校科研基金、横向课题项目等共计30项，总经费高达730万余元。学院教师以第一作者或者通讯作者发表SCI论文102篇，影响因子10分以上的论文33篇，中科院一区论文55篇，中科院二区及以上论文84篇。最高影响因子为王婉妮和钱海生老师团队在《Chemical Society Reviews》上发表的论文，影响因子40.4。